Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RHOBP62745 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RHOBP62745 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RHOBP62745 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms