Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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LMO4P61968 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LMO4P61968 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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