Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms