Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA2D1P54289 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms