Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGGT1BP53609 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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