Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RORCP51449 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RORCP51449 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RORCP51449 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RORCP51449 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RORCP51449 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RORCP51449 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RORCP51449 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RORCP51449 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RORCP51449 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RORCP51449 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RORCP51449 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RORCP51449 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RORCP51449 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RORCP51449 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RORCP51449 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RORCP51449 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RORCP51449 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RORCP51449 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RORCP51449 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RORCP51449 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RORCP51449 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RORCP51449 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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