Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB28P51157 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB28P51157 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB28P51157 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB28P51157 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB28P51157 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB28P51157 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RAB28P51157 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RAB28P51157 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB28P51157 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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