Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NESP48681 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NESP48681 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NESP48681 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NESP48681 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NESP48681 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NESP48681 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms