Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTDSS1P48651 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms