Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX3P48380 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX3P48380 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX3P48380 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms