Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.6
ITGAEP38570 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms