Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
FDFT1P37268 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms