Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms