Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CMPK1P30085 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms