Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms