Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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