Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH1P12830 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms