Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS56P0CW18 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms