Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR89BP0CG08 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms