Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB1P08034 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms