Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSLP07711 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSLP07711 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSLP07711 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSLP07711 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSLP07711 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms