Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms