Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SERPIND1P05546 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms