Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKAP2O75563 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms