Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF2O60811 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms