Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPAG9O60271 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPAG9O60271 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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