Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCEO43556 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCEO43556 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGCEO43556 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCEO43556 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCEO43556 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCEO43556 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCEO43556 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCEO43556 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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