Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNJ2O15056 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNJ2O15056 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms