Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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