Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRAMEF26H0Y7S4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms