Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms