Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms