Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL33A6NCF5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms