Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSDA5PKW4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms