Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms