Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF8Q9UPP1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms