Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIMS3Q9UJD0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms