Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms