Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UPB1Q9UBR1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms