Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLHL42Q9P2K6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms