Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RRBP1Q9P2E9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRBP1Q9P2E9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms