Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD5Q9P267 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms