Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HCN3Q9P1Z3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms