Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN6Q9NWW5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms