Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIN28AQ9H9Z2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIN28AQ9H9Z2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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