Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NYXQ9GZU5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NYXQ9GZU5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms