Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms