Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM5Q9C035 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM5Q9C035 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms