Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms