Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC8Q9BY41 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms